组织方面的障碍
1、等级和官僚结构
有的组织中强调等级分明的管理方式，要求员工绝对服从上级的领导。这种管理方式会对建设高效团队造成阻碍，因为团队中恰恰需要消除这种等级制度。
2、自上而下的管理方式
很多组织中都采用自上而下的金字塔式管理方式，而团队中一般宜采取矩阵式管理方式，以便使每一位团队成员都参与到团队管理中。如果将金字塔式管理方式套用到团队中，则可能致使团队活力不能得到发挥。
3、信息传递不通畅
在传统组织中，尤其是采用自上而下管理方式的组织中，多采用单向的、自上而下的信息传递方式，而团队需要更为灵活、通畅、迅速的信息传递方式。
管理层方面的障碍
1、管理者害怕失去权力和地位
传统组织中自上而下的管理方式决定了管理者拥有较多的权力和较高的地位；而在团队中，管理者的权力被削弱，强调成员间的平等协作。如果管理者试图保护自身利益，维护原有权力，就可能阻碍团队的建设。
2、管理者害怕自己失去价值
在团队中，成员有着不同的角色分工，管理者的角色相比于传统组织，发生了较大变化。有的管理者可能因此担心自己不再重要，团队不再需要他们。这种消极的想法不利于高效团队的建立。
3、缺乏足够的培训和支持
团队与传统的组织形式不同，对于团队成员来说，要扮演好自己的团队角色，需要学习一些新的技能。如果管理者不能提供足够的培训和支持，也会阻碍团队建设。
4、成员责任不明确
团队中强调有效授权，在授予成员权力的同时，还需要明确相应的责任，否则成员承担的角色就是不完整的，不利于团队目标的达成，也不利于成员能力的提升。
员工方面的障碍
1、害怕失去个人价值
有些团队成员的独立工作能力很强，并且一直得到大家的认可和良好的回报。他们可能会担心，团队强调共同的力量和共同的目标，那么个人的作用就变得不再明显。
2、害怕任务过重
一般的组织中，员工只要完成自己的工作职责，达到既定的绩效考核标准，就会得到相应的回报。而在团队中，虽然成员也有明确的职责，但由于团队以完成团队任务为目标，具有较强的灵活性，因此员工可能担心团队任务过重，需要投入额外的时间、精力，从而产生抵触情绪。
3、害怕承担责任
相对于传统组织来说，团队成员的角色更加独立，更有必要对自己的工作担负起责任。随之而来的责任增加可能使一些员工产生顾虑。